2022年3月3日 星期四

COVID-19疫情溯源與向中國索賠疫情損失(一)

                                                                                                                   2022/3/3

前言: 

多數人可能都經常高估自己,外行人不例外;開工後發現若要以一篇文字結束疫情系列,水準會是負的,只好增加篇數。 

工作中突然迷上一本估計以13-25歲青少年為目標讀者、年輕男主角無所不能、漂亮女生都愛他、依托現實社會百態展開的長篇網路做夢小說,居然像工作一樣夙夜匪懈地看了十天還没看完;從事情的優先順序看,這當然極嚴重耽誤正事,可見本外行人欠缺自律能力。 

對於有關溯源與索賠的事件,仍然依據若干新聞報導按時序省視,同時也簡述幾篇相關論文。又由於中、美2國政府操作溯源與索賠事件,與中美競爭實務難分循環因果,文中也會錄入幾次比較大的政治鬥爭。

一、COVID-19疫情溯源 

2019/12/31中國國家衛健委專家組到武漢市調研不明肺炎疫情後,中國專業部門是立刻開始進行疫情溯源工作的;只是政治部門介入後,過度重視政治面維穩,政治第一、○○第二、□□第三的考量使得許多原本純屬醫事、醫學、科學場域的工作立刻變調。一般說來,即使由於…,美國的抗疫表現應該還是會比中國好,但可能因為當時美國聯邦政府政治部門的奇葩性格和???的政策目標排序吧,使得20203月下旬之前的防疫抗疫表現簡直是…。 

美國針對中國人研發基因武器? 

2003/4/11 ABC NewsAustralian Broadcasting Corporation)報導:莫斯科的 epidemiological services負責人Nikolai Filatov告訴Gazeta daily不清楚是Gazeta.ruRossiyskaya Gazeta、還是),他認為SARS病毒是人造的,但有一些保留意見;俄羅斯通訊社(RIA Novosti)引述Sergey Kolesnikov醫學博士、俄羅斯科學院院士)在西伯利亞伊爾庫茨克市一次會議上的看法,SARS病毒是流行性腮腺炎和麻疹的混合物,它永遠不會出現在自然界中,我們只能在實驗室裡得到它,它可能是由於實驗室的意外洩漏而傳播。至少南非的News24同日有內容完全相同的報導。 

2003/10/1中國社會科學出版社出版童增先生著作的「最後一道防線:中國人基因流失憂思錄」,敘述從1992年開始,美國通過民間渠道在中國20多個省市,採集了中國人大量血液,提取中國人DNA,據以研發針對中國人的基因武器與傳播手段,為21世紀打基因戰積極準備;而SARS可能只是美國基因戰爭的一個實驗。對這說法有興趣的朋友可以看一下新浪新聞中心一篇報導:大部份專家表示非典「基因武器說」缺乏依據http://news.sina.com.cn/c/2003-10-09/19251887417.shtml 

2013/4/6中國空軍退役大校戴旭先生在其個人微博表示「…禽流感是美國故技重施,中國這次要吸取教訓,從容應對即可…」。20133月下旬,人類感染A型流感H7N9病毒病例開始在長江三角洲一帶城市被發現,截至2016/12/22,中國大陸共有確診病例434例,其中81例死亡(數字不完全);香港、澳門、馬來西亞、台灣均發現零星感染。這條微博至少得到人民網和新浪網轉載並附加延伸性敘述。


中國改造冠狀病毒的基因使之成為生物武器? 

2015/8/14中國軍事醫學出版社出版由徐德忠、李鋒2位先生編著「非典非自然起源和人制人新種病毒基因武器」一書,內有根據SARS的經驗,覺得用冠狀病毒來製造新型的基因改造病毒,以之做為生物武器很理想,第三次世界大戰將是生物戰,而致勝的核心武器將是生物武器…等敘述。

徐德忠教授(少將)現任第四軍醫大學(即空軍軍醫大學,位於西安)軍事預防醫學系軍隊流行病學教研室教授與博士生導師,曾任全軍軍隊流行病學專業委員會主任委員、中華臨床流行病學會副主任委員,衛生部非典疫情分析專家組組長,所在教研室被評為軍隊重點實驗室、加入國際臨床流行病學工作網,專業論著頗多。這本書在20215月成為各國懷疑中國製造冠狀病毒武器的smoking gun 

2015/11/9,美國Department of Epidemiology, University of North Carolina at Chapel Hill 10位、美國National Center for Toxicological Research, Food and Drug Administration 1位、瑞士Institute for Research in Biomedicine, Bellinzona Institute of Microbiology 1位、美國Department of Cancer Immunology and AIDS, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School 1位、中國武漢病毒研究所2石正麗博士與其學生葛行義),共15位研究同仁在《自然醫學》雜誌發表一篇題為A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence一種類SARS傳播性蝙蝠冠狀病毒群顯示感染人類的可能性https://www.nature.com/articles/nm.3985的論文,表示研究結果顯示「…在這些發現的基礎上,我們以合成方法再度得到有傳染力的SHC014基因重組完整病毒體,這病毒體在小鼠體外和體內都顯示出強大的複製能力。我們的研究顯示目前有從所有在蝙蝠中流傳的病毒裡再度出現SARS-CoV的風險」。論文中說當時SHC014-CoV在中國馬蹄蝠種群中流行。從這篇論文的15位作者中有13位美國研究人員、以及論文末所附貢獻錄看,美國研究人員做了大部份研究工作。研究得到US National Institutes of Health NIH-美國國立衛生研究院National Natural Science Foundation of China(中國國家自然科學基金會)、USAID-EPT-PREDICT funding from EcoHealth Alliance (Z.-L.S.)(美國國際開發署通過生態健康聯盟提供)的資助,以及若干美國研究機構的協助;看起來美國提供了大部份研究經費。石正麗博士從SARS疫情2003之後没有中斷過對冠狀病毒、蝙蝠類冠狀病毒之研究,可預測今後相當長時間,這類研究在傳染病研究場域中仍會是顯學。 

在上述徐德忠教授的著作進入美國政府之視界後,一般認為武漢病毒所與西安第四軍醫大學軍隊流行病學教研室之間(石正麗博士與徐德忠教授之間)不會没有連繫,這使得美國許多人強化了新冠病毒是由武漢病毒研究所研製的懷疑。 

2016/2/18石正麗團隊刋佈論文Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft(多個冠狀病毒在廢棄礦井的幾個蝙蝠群中共存https://link.springer.com/article/10.1007/s12250-016-3713-9),敘述2002-2003年爆發SARS疫情,促使大家尋找SARS冠狀病毒的天然宿主,在世界各地的蝙蝠身上發現了許多αβ類冠狀病毒;蝙蝠可能是這2類冠狀病毒的天然宿主。2012-2013年,研究團隊在中國雲南省墨江縣一個廢棄礦井中對蝙蝠身上的冠狀病毒進行了監測;在洞穴中經常檢測到6種蝙蝠。經過基因測序,發現礦井中不同種類蝙蝠身上感染多樣冠狀病毒群的頻率很高;監測還發現了兩種未分類的β冠狀病毒、一種新型SARS樣冠狀病毒、和一種可能是新的β類冠狀病毒種。由於在所有6個蝙蝠物種中都檢測到冠狀病毒合併感染,這種病毒合併感染現象會孕育病毒重組,從而促進新型病毒種族的出現。因為蝙蝠種類多,又分佈全球,蝙蝠冠狀病毒的數量可能增加。 

2016年石正麗在「一席」演講《追蹤SARS源頭》https://open.163.com/newview/movie/free?pid=MDV2RFF99&mid=MDV2THAE0 一席是中國大陸仿TED的知識、觀點分享交流平台。 

2018/3/2石正麗博士團隊於PMC刋布論文Longitudinal Surveillance of Betacoronaviruses in Fruit Bats in Yunnan Province, China During 2009–2016 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6178081/2009-2016年中國雲南省果蝠β冠狀病毒縱向監測):科研界已知冠狀病毒通過呼吸系統和腸道感染宿主,本研究發現腸道組織是果蝠所攜帶的BatCoV HKU9、與BatCoV GCCDC1病毒的主要標靶,然而在蝙蝠的心臟、腎臟和肺中也檢測到了一些HKU9,表明BatCoV HKU9具有較廣泛的組織嗜性(tissue tropism),有可能通過口糞途徑和呼吸道傳染其他動物。中國至少有五種果蝠,均分佈於熱帶地區,這些果蝠以水果和花卉為食,並經常與農場和人接觸,從而增加了蝙蝠病毒向家畜和人類外溢的風險,其溢出潛力有待進一步研究。本研究突顯了對病毒天然宿主進行病毒監測的重要性,同時需要採取措施,防止這些病毒溢出到蝙蝠洞附近居民身上。通過全基因組定序,本研究還鑑定出一種新的HKU9基因組,暫時定名為BatCoV HKU9-2202,它與其他BatCoV HKU9的核甘酸具有83%同一性;雙方差異最大的區域在刺突蛋白,2者刺突蛋白的氨氨基酸相同性只有68%隱含2者刺突蛋白的氨基酸可能有一部份會自然產生突變的意思)

------------------------------

2019/12/31中國國家衛健委專家團隊赴武漢調查不明肺炎情況的第一天,中國網路上就有武漢華南海鮮批發市場(位於漢口火車站附近)不明肺炎是美國人下毒之類的言論。

一開始國際新聞媒體依慣例以始發地之地名稱呼疫病疫情–武漢肺炎,

中國政府不高興。於是除很少數人外,大家都在世衛組織2020/1/13對疾病和病毒暫時命名後改稱新冠肺炎、新冠病毒(新型冠狀病毒感染的肺炎、novel coronavirus2019-nCoV),並自然認為武漢為病源地。 

2020/1/21中國科學院生物安全大科學中心上海巴斯德研究所分子病毒學與免疫學重點實驗室、上海中國科學院分子植物科學卓越中心合成生物學重點實驗室、教育部系統生物醫學重點實驗室上海交通大學上海系統生物醫學中心等5所位於上海、北京、廣州的研究機構,其8位研究人員合作,比較了武漢不明肺炎病毒Wuhan CoV)與SARS-CoVMERS-CoV的基因序列,今日將研究結果以Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission為題,在「中國科學:生命科學」英文版Science China Life Sciences發表。Science China Life Sciences2020/1/16收到論文、1/20接受、1/21在線上發表。 

Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission(武漢爆發中新冠病毒的演變、及其與人際傳播風險有關的刺突蛋白建模)論文摘譯(摘譯者:本文) 

8位研究人員於合作比較了武漢不明肺炎病毒Wuhan CoV)與SARS-CoVMERS-CoV的基因序列後發現 

    Wuhan CoVSARS-CoV存在相當大的遺傳距離,與MERS-CoV的遺傳距離更大,Wuhan CoVSARS-CoV的同源性homology高於MERS-CoV因此蝙蝠為Wuhan CoV原生宿主是合乎邏輯且合宜的推論,雖然病毒在從蝙蝠到人類的階梯狀傳播鏈間仍然存在其他中間宿主的可能性。當然病毒從上游到人類之間可能只存在蝙蝠這一階宿主,也可能不只一階,也可能Wuhan CoV本研究推論的原生蝙蝠病毒同階…。 

    儘管總體上Wuhan CoVSARS-CoV雙方刺突蛋白S-protein源性低,但在比較雙方刺突蛋白RBD(受體結合區域的基因序列時發現,雙方於若干斑位patch)有高度同源性;SARS-CoV5個斑位(442472479487491)的殘基(residue)被認為在物種與物種之間、人與人之間傳播病毒時起了關鍵作用。雖然Wuhan CoV在其RBD存在與上述SARS-CoV 5個斑位有高度同源性的部份,但上述5SARS-CoV斑位殘基中只有491維持不變,其他4個殘基有變化… 

    研究者在對Wuhan CoVSARS-CoV兩者的刺突蛋白結構建立3D模型後,發現兩者的氨基酸序列有76.47% 相同。而在比較兩者RBDACE23D複合模型,以評估其與人類ACE2分子的交互作用能力後,Wuhan CoV刺突蛋白顯示其對人體ACE2有更強的結構疊加和分子對接能力,亦即更有親和力

Model of structure of novel coronavirus spike receptor-binding domain (pink) complexed with its receptor ACE2 (blue). Image Credit: Volodymyr Dvornyk/Shutterstock.com  本文自Dr. Osman ShabirWhat is a Receptor-Binding Domain (RBD)一文中轉錄此圖。 

    本研究顯示Wuhan CoVSARS/SARS-like冠狀病毒有共同的、類似蝙蝠冠狀病毒HKU-1的祖先;Wuhan CoV刺突蛋白的RBD與人體的ACE2分子會有強大的交互作用,因此Wuhan CoV通過其刺突蛋白與人體ACE2之結合途徑,所引發的人際傳播,會導致重大的公共健康危險。 

RBDreceptor-binding domain受體結合區域,是冠狀病毒刺突體的一部份,最早接觸人類受體細胞膜)ACE2Angiotensin-converting enzyme 2血管收縮素轉化酶2一種位於人體肺、動脈、心臟、腎臟、腸道等組織細胞表面的膜蛋白。這篇論文似乎暗示在SARS-CoV442472479487斑位上,與SARS-CoV原始殘基不同的4個胺基酸,使得Wuhan CoV具有比SARS-CoV更強的物種與物種之間、人與人之間的傳播能力。8位研究人員之論文(致編輯函)位址在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7089049/pdf/11427_2020_Article_1637.pdf


石正麗博士領導來自若干不同醫研機構的科研團隊,繼2020/1/2確定新冠病毒全基因組序列1/5成功分離病毒株1/9完成病毒株在國家病毒資源庫入庫→…1/22前後,於bioRxivNature等多個生物與醫研訊息交換平台,以2個標題Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat originA pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat originhttps://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7.pdf自然雜誌1/20收稿、1/29接受、2/3線上刋行)分別發表2篇論文,說明在武漢引起不明肺炎流行之病毒2019-nCoV的特徵、屬性、傳播途徑,它SARS-CoV具有79.6%的基因序列同一性,它在全基因組水平上與從雲南馬蹄蝠身上發現的冠狀病毒有96.2%的相同性屬於 SARSr-CoV 似乎北京的科研團隊也在差不多時間分離出另一病毒株…;從上段所述「中國科學:生命科學」英文版所發表的論文看,上海科研團隊的研究速度很快;北京、上海、武漢3個研究單位都很快。據報導初期從武漢市病患身上所取得病原體之基因序列相同。

2020/1/22中國疾控中心主任高福博士今天上午在國務院新聞辦公室的新聞發布會上表示「我們對這個病毒正處於一個認知過程中,現在看來,它在很多方面有冠狀病毒出現時的一些共同特點,但這個病毒同時也表現出自己的一些特點,包括它的來源。對於這個病毒的來源,現在大家都聚焦到一個市場裡,這個市場裡有野生動物交易,所以來源可能是野生動物及它所污染的環境。一開始只是動物到人的傳播,再就是病毒進行對宿主的適應突變病毒和人類的關係就像貓鼠遊戲,在互相適應。到現在這個階段,確實出現了人傳人的現象,而且已經出現一些社區傳播。所以說,它經過了三個過程。從現在看,它的來源就是海鮮市場銷售的野生動物,這個野生動物的病毒也在逐漸適應」。 

2020/1/23中國為避免或大量減少病毒自疫源地武漢市向外傳播,今日上午封鎖武漢市。當日湖北省政府請中科院武漢病毒所牽頭,邀集13位相關學科專家組成新型肺炎應急科研攻關研究專家組,由病毒所石正麗研究員任組長,就新冠肺炎快速檢測試劑、疾病發生∕發展∕轉歸規律及臨床診治、抗病毒應急藥物和抗體類藥物、動物溯源、病原學及流行病學、動物模型與病理、病毒感染導致免疫過激與炎症、疫苗等8個方面展開研究,努力為一線防控治療工作提供科技支撑。 

1/26中國疾控中心病毒病所稱,該所從首次華南海鮮市場取得的585份環境樣本1/1 515份+1/12野生動物販賣商鋪70中,檢測到33份樣品含有新冠病毒核酸,這些陽性樣本分布在22個攤位和1個垃圾車;其中31份來自經營野生動物的西域,並成功在陽性環境標本中分離病毒,提示該病毒來源於華南海鮮市場銷售的野生動物,但該所未鎖定具體是那一種野生動物。國家衛健委主任同日表示,目前對新型冠狀病毒的認識還十分有限,傳染源還没有找到。至此華南海鮮市場是疫源地的說法成為官方定論。但有報導華南海鮮市場並不買賣蝙蝠,也未發現蝙蝠的蹤跡,那蝙蝠與人之間應有病毒的中間宿主。同時在中國最早的幾份研究報告中,都報告了流行病學調查結果有34%45%50%没有華南海鮮市場接觸史,顯示海鮮市場可能並非病毒唯一來源地。 

2020/1/26中國一個民間軍事網站西陸網www.xilu.com,刋載一篇以「武漢病毒4個關鍵蛋白被替換,可精准攻擊華人」為題的文章,將上述上海團隊研究結果非常有創意地大量加油添醋摻辣後說「看完報告,讓人在驚恐之餘更加憤怒無比!關鍵在於武漢新型冠狀病毒換掉了4個關鍵蛋白,第一其目的就是為了偽裝成SARS病毒,讓防疫者難以分辨,誤入防治非典(SARS)的老路,延誤救治的時間;第二是使它具有有很強的對人感染能力,達到快速蔓延和傳染的目的。這種滅絕人性的生物技術是蝙蝠和竹鼠幹得出來的嗎?在自然界環境中即使1萬年也不可能實現如此精準4個關鍵蛋白的替換!事實證明,武漢病毒只能是實驗室干預製造產生的!人性已經泯滅到了如此地步!帝國主義從來就沒有停止過對中國的各種破壞打擊和圍剿,中國的迅速壯大和崛起,已經讓帝國主義到了撕下所有偽裝,公開出手的地步。敵人總是不擇手段的,我們起碼要對等還擊!再次強調:我們是人,要以人道規則行事,要以牙還牙、以血還血!從非典到武漢新型肺炎,看美國種族滅絕計畫」。看起來像剿美檄文。這篇文章後來從網站上消失,但WaybackMachineInternet Archive留有存檔。不知道西陸網背後是否有中國軍方支持? 

1/29瑞士諾華製藥集團(Novartis International AG)執行長Vasant Narasimhan表示他預估需要花超過一年時間來真正找到新冠疫苗,目前需要靠流行病學控制手段來使疫情處於好一點的狀態。 

1/30位於印度首都新德里(New DelhiKusuma School of biological sciences, Indian institute of technology9位學者於bioRxiv發表題為Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag2019-nCoV刺突蛋白中獨特插入片段與HIV-1 gp120 Gag之不可思議相似性的預印論文。https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full 

Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag論文摘譯(摘譯者:本文) 

我們正在目睹由2019年新型冠狀病毒2019-nCoV引起的傳染病,2019-nCoV的演變仍然難以捉摸。 

在對NCBI refseq ncbi.nlm.nih.gov)中所有冠狀病毒(2019-nCoVBat-SARS-LikeSARS-GZ02MERS的刺突糖蛋白氨基酸序列進行多序列比對後發現,2019-nCoVSARS-GZ02兩者刺突蛋白的演化有最接近的顯著多樣性。 

由於2019-nCoVS蛋白與SARS GZ02具有最接近的祖先,於比較這2種病毒其刺突蛋白的基因編碼序列後,在2019-nCoV的刺突糖蛋白中發現了4個新的插入。這些插入不僅在SARS的刺突蛋白中不存在,而且在冠狀病毒科內任何其他成員中也沒有觀察到。這令人吃驚,因為病毒不太可能在短時間內自然地獲得這種獨特的插入 

這些插入存在於最近所有臨床分離株的2019-nCoV基因組序列中。為了解這些插入的來源,將這些插入與所有病毒基因組進行局部比對;出乎意料,所有插入都與HIV-1匹配。進一步分析顯示,前3個插入的氨基酸殘基與HIV-1 gp120、第4個與HIV-1 Gag中的氨基酸殘基具有同一性或相似性。 

有趣的是,儘管這些插入在原始氨基酸序列上是不連續的,但2019-nCoV3D建構模型顯示它們之中至少有3個會聚集在一起構成受體結合區域;研究者推測,這些插入通過在蛋白質結構中形成親水環,為糖蛋白結合位點提供額外的靈活性,從而促進或增強病毒與宿主的相互作用,為2019-nCoV提供了額外的生存和感染力優勢。這種插入可能使得原本在動物之間感染的冠狀病毒變得可以感染人類,這種非常規演變值得進一步研究。 

在病毒之間交換基因物質是眾所周知的,像這種關鍵性交換凸顯了交換的風險,以及需要對看似無關之病毒家族之間的關係進行調查。 

這項研究提供了對於2019-nCoV仍為未知的洞察性見解,同時對病毒演化與致病力的調查分析提供了重要的關聯性指引 

NCBI refseq National Center for Biotechnology InformationReference Sequence Database上述摘譯除大幅簡化外,也改動了若干原論文敘述的順序。已知有不少易感細胞中的弗林蛋白酶,能在與SARS-CoV以外的多種冠狀病毒之刺突蛋白接觸時,形成弗林蛋白酶割裂區位(furin cleavage site),有助於病毒侵入受體細胞;問題是為什麼在SARS-CoV中,2019-nCoV的刺突蛋白中會獨有4個插入


HIVhuman immunodeficiency virus人類免疫缺乏病毒,又稱愛滋病毒 

HIV是一種感染人類免疫系統細胞的慢病毒,有HIV-1HIV-2兩型,多數國家的HIV感染是由HIV-1造成的;超過90%HIV-1感染者會在10-12年內發病(愛滋病)。 

gp120是病毒顆粒表面被膜的糖蛋白基因;Gag是病毒基因組兩條相同正股RNA兩端之間的結構蛋白基因,構成病毒衣殼。 

HIV選擇性地侵犯帶有CD4分子的細胞,主要有T4淋巴細胞、單核巨噬細胞、樹突狀細胞等。HIV囊膜蛋白gp120識別易感細胞表面的CD4分子,透過gp120與受感染細胞膜上的CD4結合後,經由HIVgp41跨膜蛋白介導,使病毒穿入受感染細胞,造成受感染細胞破壞。 

慢病毒屬(Lentivirus 

其特徵是有較長時間的潛伏期;可以由宿主細胞直接感染周圍的細胞,不必經由形成病毒顆粒此一步驟。 

慢病毒可以將大量與病毒互補的DNA整合到宿主細胞的DNA中,並且可以有效地感染非分裂細胞,因此它們是最有效的基因傳遞方法之一。它們可以變成內生性的(endogenous),將它們的基因組整合到宿主生殖(種系)基因組germline genome)中,由宿主的後代遺傳延續。


石正麗博士研究團隊進行過SARS-CoV RBD功能增強實驗 

2010/6/22中、澳、美38位研究同仁(中國武漢病毒研究所5位、Australian Animal Health Laboratory, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization Livestock Industries 2位、Department of Pharmacology, University of Minnesota Medical School 1位)聯名發表論文Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) proteins of different bat species confer variable susceptibility to SARS-CoV entry[不同蝙蝠種類的血管緊張素轉換酶2ACE2)蛋白對SARS-CoV進入具有可變的易感性https://link.springer.com/article/10.1007/s00705-010-0729-6],提到使用

HIV/BJ01-SAn HIV-1-luciferase pseudotype virusSARS-CoV BJ01 S protein),分別對79隻蝙蝠、果子狸、以及人類ACE2的基因重組(嵌合)質粒進行假性病毒感染檢測,發現水鼠耳蝠Myotis daubentonii和中華菊頭蝠Rhinolophus sinicus有可能成為人類SARS-CoV或其高度相關的果子狸SARS-CoV的直接宿主;另一重要發現是蝙蝠ACE2蛋白具有巨大的遺傳多樣性,其基因序列變化,特別是在對SARS-CoV結合至關重要的位置,如殘基27313541…。 

從論文圖2A看,人類ACE2的易感程度最高。運用HIV-1包膜假型病毒載體媒介(HIV-1 envelope pseudotyped viral vectors)與有感染力的分子複製品infectious molecular clones)進行特定實驗在生物科學界是常見的。把石博士這一篇論文和上文所述2015/11/9的論文連起來看,說石博士研究團隊進行過SARS-CoV RBD功能增強實驗是合理的。在各研究場域中對研究標的進行功能強化或弱化實驗幾乎是天經地義的,人們鍛鍊身體就是希望增強自己身體的功能。


1/30在參議院軍事委員會與軍方領導人舉行的聽証會上,不曉得是不是為了對1/26中國西陸網貼文進行反擊,參議員Tom Cotton說新冠疫情事件是比車諾比Chernobyl)核事故還要嚴重的事故;在最初的40例病例中,有14例,包括零號病例,與華南海鮮批發市場沒有接觸;有幾個關於病毒起源的陰謀論,一個是該病毒起源於與中國生物戰計劃有關的實驗室…;我們仍然不知道病毒起源於何處。這個敘述是中性的,Tom Cotton參議員一週多來對中國處理疫情的批評也有理;但他在推文和接受新聞媒體採訪時表達意見的方式,讓人覺得他似乎在刻意推廣病毒可能與武漢P-4級國家生物實驗室有關,並且可能源自中國的生物戰計劃」這個陰謀論。美國參議員的言行通常動見觀瞻。

2/1兩個研突報告∕論文預印網站bioRxiv and medRxiv的共同創辦人Richard Sever博士今日於其推特發文:Authors of disputed “uncanny” 2019-nCoV preprint to voluntarily withdraw preprint: "It was not our intention to feed into the conspiracy theories...we appreciate the criticisms...and will get back with a revised version”◆没有在網上看到論文作者們自己具名發聲明撤稿,但本文不認為Richard Sever博士會在没有得到論文作者群同意的情況下發出上述推文 

2020/2/2下午石正麗博士在微信朋友圈發布貼文

設身處地,我們可以想像當時石博士所承受巨大的工作和心理壓力。但「閉上你們的臭嘴」這類情緒性語言還是不好。 

2/3華爾街日報刋登了一篇美國學者評論中國抗疫表現的專欄文章,譴責中國官方在疫情初起時掩蓋疫情真相、防疫行動遲緩、後續恐怕帶來金融危機,儘管最後可以控制疫情,但其表現動搖了外界對中共的信心。這篇邏輯清楚而合理、用語平實的文章被華街日報編輯加上「中國是真正的亞洲病夫」這個與內文八竿子打不著的聳動標題,還配上「中國的金融市場可能比其野生動物市場更危險」這個有強烈醒目功能的副標題。(華爾街日報駐北京分社社長2/22發起,共有該報53名在大陸員工,聯名向該報社管理階層寫信,認為編輯部做了錯誤的標題選擇,冒犯了不僅在中國的許多人,希望該報為不當標題公開致歉。華爾街日報有一名發行人就這篇文章所引起的風波表示遺憾)2020/3/16華爾街日報以People Fleeing Coronavirus Head to a New Safe Haven: China為題刋登了一篇報導,說數週前人們為躱避新冠病毒逃離中國,現在情況翻轉了,人們前往中國,因為他們相信那裡是世界上最安全的地方不知道什麼原因華爾街日報編輯部失態的程度更甚於昨天的石正麗博士。由美國參議員+華爾街日報發動的口水攻擊,其帶動的國際輿論強度當然比中國民間西陸網站帶動的要強得多。 

2/4網名武小華博士的女士發了一篇指責石正麗博士騙人的文章,大意是實驗室裡實驗用的SPF動物譬如大鼠、靈長類(原猴、類人猿),很可能在實驗時成為蝙蝠與人類之間的新冠病毒中間宿主→管理不善的實驗室員工私自向外販賣實驗用動物→病毒傳播到人身上→…。實驗動物根據對於微生物的控制狀況,一般分為四個等級:第一級為無菌Germ Free)動物、第二級為帶特定病原Gnotobiotic)動物、第三級即為無特定病原 SPF Specific Pathogen Free)動物、第四級實驗動物稱為一般Conventional)動物。有興趣的朋友不妨看一下這篇有科普意義的短文「武小華博士:我知道的和你該知道的一切https://digest.creaders.net/2020/02/09/2188430.html自然有人上天下地探查武小華博士是什麼樣的人;她似乎是位没有大學學位,但勇於且善於把握機會、力爭上游者;武小華為其實名。 

2/6華南理工大學生物與生物工程學院肖波濤Botao Xiao博士、與武漢科技大學天佑醫院雷曉Lei Xiao博士上傳European commercial social networking site for scientists and researchers Researchgate一篇題為The possible origins of 2019-nCoV coronavirus的文章https://img-prod.tgcom24.mediaset.it/images/2020/02/16/114720192-5eb8307f-017c-4075-a697-348628da0204.pdf,指出被認為是2019-nCoV近親的CoV ZC45,是從雲南和浙江捕獲的蝙蝠身上發現的,它們飛行900公里到華南海鮮市場附近的機率很低;武漢人不吃蝙蝠、華南海鮮市場也不買賣蝙蝠;迄今並無証據能証明2019-nCoV起源於CoV ZC45的自然重組+中間宿主。病毒也可能自距華南海鮮市場12公里,研究蝙蝠冠狀病毒的武漢病毒研究所外洩,但該所一再否認洩露病毒的可能性。武漢另有一個由武漢市疾控中心負責運營的P2實驗室也研究蝙蝠冠狀病毒,它離華南海鮮市場不到280公尺,將捕獲的蝙蝠收養在實驗室中供研究,其中一項研究是收集並鑑別病原體;曾在一項研究中從湖北捕獲了包括菊頭蝠類共155隻蝙蝠,還從浙江捕獲450蝙蝠;研究人員對籠養動物進行手術,收集它們的組織樣本以提取DNARNA並測定基因序列;組織樣本和受污染的垃圾是病原體的來源;這可能導致華南海鮮批發市場爆發病毒感染,臨近實驗室的協和醫院醫生也成為第一批受感染的醫生。總之對於產生高生物危害風險的實驗室需要提高其安全等級,也可以依循法規將它們遷移到遠離人口密集區域的地方。武漢市疾控中心實驗室於2019/12/2搬到這個靠近華南海鮮批發市場的地址(?),中國政府說該實驗室搬遷時没有發生交通中斷和意外事件,疫情爆發前没有儲存冠狀病毒或蝙蝠所攜帶的其他病毒,也没有進行相關實驗活動。若該實驗室没有做過冠狀病毒基因改造實驗,則成為突變病毒來源的機率不高;當然不能說自然突變病毒絕無可能存在於被該實驗室捕獲的蝙蝠身上。這篇文章很快就被作者刪除,但外界仍然搜尋得到。 

2/7廣州華南農業大學校長在發佈會上透露,華南農業大學、與嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室科研人員,通過分析1,000多份宏基因組樣品,鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的可能中間宿主;繼而通過分子生物學檢測,揭示穿山甲中β冠狀病毒的陽性率為70%進一步對病毒進行分離鑒定,電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結構;最後通過對病毒的基因組分析,發現分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達99%。以上結果表明,穿山甲為新型冠狀病毒的可能中間宿主。學校及實驗室將密切關注新型冠狀病毒可能對我國畜禽業及農業生產造成的影響,加強動物重大疫病及動物源性人畜共患病的監測及研究工作。相似度高達99%很高;不過後續發布的幾篇研究論文都表示,比對穿山甲冠狀病毒基因組與新冠病毒的相似性在90%上下,與新冠病毒不是同一個病毒,穿山甲是新冠病毒可能的中間宿主,但不是中間宿主中間宿主要求99%或以上相似性。華南農業大學後來表示2/7的報導是誤報,將相似度修正為90.3%

2/9中國駐美大使接受美國CBC NEWS Face the Nation節目訪問時說「…還有很多未知,中國、美國、其他國家的科學家正在盡最大努力於更加了解這種病毒。但在民眾中挑起並傳播猜疑和謠言是有害且危險的,一方面可能造成恐慌,另一方面會煽動種族歧視和仇外心理,這些事會損害我們共同抗擊病毒的努力。有各種各樣的猜測和謠言,有人說病毒來自中國的生物戰計畫,有人說病毒來自美國某軍事實騇室,我們如何能相信所有這些瘋狂的事呢?」 

2/14中共總書記主持召開中央全面深化改革委員會第十二次會議時說「要從保護人民健康、保障國家安全、維護國家長治久安的高度,把生物安全納入國家安全體系,系統規劃國家生物安全風險防控和治理體系建設,全面提高國家生物安全治理能力。要盡快出台生物安全法,加快構建國家生物安全法律法規體系、制度保障體系」。宣示、誓言、立法嚴管…都表示決心,不過人類大眾習性改變這類從量變到質變的事,幾乎都是漸進的,需要時間。

2/16由德國、尼日利亞、俄羅斯、新加坡、日本、韓國、加拿大、美國和世衛13名外籍專家,及12名中國專家組成的25人新冠肺炎聯合考察組,今天開始到北京、成都、廣州、深圳和武漢等地進行9天的實地考察調研。2/25考察組負責人在日內瓦世界衛生組織總部舉行記者會,高度評價中國所採取務實靈活的大規模防控措施,認為這不僅使中國新增感染病例大幅下降,也為各國積極防控疫情爭取了寶貴時間,提供了值得借鑒的經驗…。這次考察似乎未著力於病毒溯源,但這個時候把重點放在防疫抗疫經驗檢討,以提高防疫抗疫能力是合理的。 

2/16美國參議院軍事委員會成員Tom Cotton在接受Fox NewsSunday Morning Futures採訪時提到,應該查明持續傳播中的新冠病毒,是否與離那個被認為是病毒傳播起點的市場只有幾英哩遠的,中國唯一一所生物安全性等級4,研究人類傳染病的實驗室(意指中科院武漢病毒研究所)有關。這段發言是中性的,邏輯上,就病毒溯源研究而言,調查中科院武漢病毒研究所是必不可少的環節之一;而該所由石正麗博士領導的團隊可能是目前全球最有能力進行新冠病毒溯源研究的團隊之一。但該所目前有中國境內唯一的P4生物安全等級實驗室,理論上中國目前危險性最高、最高端的生物研究很可能會在該所進行。不知道有那些國家願意完全公開其P4實驗室中進行的研究項目? 

2/18大紀元新聞網報導一篇由新冠病毒探源調查組所撰寫的「【病毒探源】調查報吿:新冠病毒神祕來源」,暗示病毒的來源可能非自然。該文的目標讀者為一般大眾,條理清楚而簡潔,值得關心病毒溯源的朋友閱讀。原文鏈接https://www.epochtimes.com/b5/20/2/17/n11874228.htm 

2/18美國國務院宣佈將5家中國主流官方媒體認定為外國使團,視為中國政府的一部份,需要向美國國務院提交在美工作人員的姓名、個人資料及人事變動決定,並向國務院登記在美租賃或持有的房產清單。未來這些機構若在美租賃或者購買新的房產也需提前獲得許可,但不限制這些中國媒體在美國的新聞報導活動。 

2/19中國外交部以華爾街日報於2/3刋登「中國是真正的亞洲病夫」一篇涉及種族歧視文章為由,宣佈吊銷華爾街日報3名駐北京記者的記者証。


2/19 THE LANCET發佈由業界27位權威科學家聯名發表的Statement in support of the scientists, public health professionals, and medical professionals of China combatting COVID-19支援中國正抗擊2019年新冠疫情的科研、公共衛生、醫務工作者的聲明),表示「…來自世界各國的科研工作者已對引發該疾病之病原SARS-CoV-2的全基因組進行了分析並公開發表了結果,這些結果壓倒性地證明了該冠狀病毒和其它很多新發病原一樣來源於野生動物。該科學結論也得到了來自美國國家科學、工程、醫學院院長及其所代表的科學界人士的支持。陰謀論除了製造恐慌、謠言、偏見、損害全球共同抗擊該疾病的工作外,別無它用。我們支持世界衛生組織總幹事的呼籲:促進科學的論證和團結,而非誤傳和猜想。我們希望所有奮戰在中國第一線的科研和醫務衛生工作者們知道,在此次與病毒的鬥爭中,我們同您們站在一起。我們邀請更多的人加入我們,一同來支持在武漢和全中國的科研、公共衛生及醫務工作者,和我們戰鬥在第一線的同行們站在一起」。

本文不認為曾涉及新冠疫情與病毒溯源的科研工作者們、以及有其他場域實驗室研究經驗的科研工作者們,會完全排除病毒來自實驗室洩露的可能性。和科研工作者們一樣本文認為當時武漢市和中國的抗疫工作仍在艱難時刻,同時其他各國面對疫情漫延的壓力正迅速增加中,亟需全球合作;美、中兩國中央政府行為能力強大的政治部門,在此時鼓動相互甩鍋風潮的「手法」是很不正派的;今後不會繼續表演「是你們先的、是你們先的…」這種兒戲給全球同胞看吧?27位署名者都在信中聲明與表態事件没有競爭利益,但後來參與署名的Peter Daszak先生被發現由其擔任總裁的EcoHealth Alliance長期資助武漢病毒研究所;於是THE LANCET編輯部邀請信件的27位署名者重新評估他們的競爭利益,並將Peter Daszak先生的更新於2021/6/2以補遺為題公開發表。
                                               ----------------------------------------------

沒有留言: